Si solo por defecto se pueden poner 5 habilaides para aprender ,se pueden mas? mi idea es poner otros bonus pasivos que serán invisibles después de ser aprendidos,solo me falta agregarlos allí para que se puedan aprender

Pues eso es imposible, podrías usar un libro de conjuros, que se agregue al subir de nivel y contenga las habilidades a aprender, por supuesto serían habilidades dummy de uso instantáneo.

También podrías usar un segundo héroe al que le des un punto para aprender habilidades cuando tu héroe principal sube de nivel y sólo contenga los pasivos.

La solución que requiere menos detonadores es la segunda, también requiere menos habilidades dummy, pero tu elige cuál prefieres

Estoy de acuerdo con marcos esas son las 2 mejores opciones pero me parece que la mejor es la de el libro de conjuros ya que queda todo mas bonito y en la misma unidad pero con ambas opciones puedes hacer buenos trabajos

Si voy a hacer ese o creo un sistema de actualización para que de a partir del nivel 15 el héroe pueda ser mejorado desde una unidad

Esa opción también sirve